3月28日，经作所蔬菜团队在国际学术期刊《Frontiers in Plant Science》(JCR一区，IF=6.627)在线发表题为“Identification of CaPs locus involving in purple stripe formation on unripe fruit, reveals allelic variation and alternative splicing of R2R3-MYB transcription factor in pepper (Capsicum annuum L.)”的研究论文。

辣椒以果实为商品器官，从青熟期到老熟期颜色变化多样，最为常见的类型为青熟期绿色，老熟期红色，其他还有白色、黄色、橙色、紫色和咖啡色等，未成熟辣椒果实表面花青素的不均匀分布使得辣椒产生紫色条斑的“竹丝辣椒”表型。本研究以田间发现的紫色条纹稀有突变材料Chen12-4为研究对象，利用连锁作图和染色体步移方法将调控辣椒紫色条纹(Purple stripe)形成基因CaPs定位在10号染色体841.39 kb的物理区间内，区间注释表明R2R3-MYB转录因子CA10g11690是CaPs的候选基因。进一步的病毒诱导沉默和过表达烟草表明，CA10g11690是调控辣椒果实紫色条纹形成的基因CaPs。对双亲本间CA10g11690序列比较显示，紫色条纹亲本的内含子区存在1,926 bp 的大片段插入，启动子区存在49个SNP、2个deletion和4个Indel;CA10g11690在辣椒中存在可变剪切，紫条纹亲本中的转录本c690Short-Chen12-4与花青素积累密切相关。根据CA10g11690在双亲中的序列差异分析，开发了与紫色条纹性状共分离的基因标记SCAR690-01，可用于分子标记辅助选择育种。本研究丰富了辣椒花青素合成调控理论，为辣椒紫色性状研究提供新案例，对培育富含花青素的辣椒品种具有应用价值和指导意义。

李宁博士和硕士研究生刘亚博为论文的共同第一作者，王飞和姚明华研究员为本论文的共同通讯作者，省农科院经作所为通讯单位，长江大学园艺园林学院和韩国首尔大学农业与生命科学学院均参与了本研究。该论文获国家重点研发计划项目(2021YFD1600300)、湖北省国际科技合作项目(2022EHB040)、武汉市知识创新专项、湖北省重点研发计划项目(2022BBA0060)、湖北洪山实验室重大项目(2022hszd009)和现代农业技术体系建设专项资金项目(CARS-23-G28)共同资助。